两度“转行”之后,95 后贵州小伙以一作身份,在 Science 发表了第一篇文章。
而这距他刚入门,也才不过两年时间。
他叫做胡脊梁,曾以物理竞赛保送到清华钱学森力学班(“钱”班),随后在大二那年跟随兴趣所向。
在听了施一公讲座之后,他决定转至细胞动力学,一个物理和生物交叉研究领域。
中国科学院院士郑泉水曾对他印象深刻,
为了完成一篇论文,他一年时间学了 20 门研究生的课程。这个学生在“钱班”成绩一般,但是他用论文一样可以证明自己。
本科毕业、直博,而在一切看似顺风顺水之际,他又突然换方向,转硕再读博,研究更加复杂多样的生态动力学。
入门 2 年一作发 Science
不妨就以他最新的 Science 论文成果,来介绍他的研究领域。
一言以蔽之,这篇文章在解决“是什么导致生态系统不稳定?”的问题。
事实上这个问题由来已久,过去许多科学家都在致力于破译其中所有的影响因素。
这其中较为著名的两个预测因素为,群落中物种的数量以及物种之间的相互作用。
然而这放在现实自然系统中却很难得到验证,即便可以观察物种之间的相互作用,通常也无法完成控制实验。
而胡脊梁所在的团队,解决这个问题的途径是:物理学。
为生态系统创建一个“相图”,最终验证需要结合着两个参数:物种数量和种间相互作用强度整合一起,成功预测生态群落稳定与否的情况。
具体而言,他们在实验室合成了 2 到 48 种细菌的生态系统,监测群落在生长、分散和稀释周期中群落的组成和生物量。
此外他们发现,成对共生的概率随着补充的葡萄糖和尿素浓度的增加而降低。这意味着,通过增加营养物质的方式,可以用来加强物种之间的相互作用。
实验结果显示,群落生物量的波动在物种规模或者相互作用强度增加下,也会同样增加。以 48 个物种群落为例,研究人员发现只有在低营养浓度下才会达到稳定。
最后他们还绘制了“相图”,描述生态系统如何仅基于两个因素发生变化。类似于物理中基于温度和压力,来描述水的状态变化。
结果显示,相同条件下,波动的群落比稳定的群落更加多样化。
通讯作者、胡脊梁的导师 Jeff Gore 表示,相图的惊人之处在于它可以以非常简单的形式总结大量信息,找出一个边界来预测稳定性的丧失以及波动的开始。
据中国科学报报道,这是学者第一次对复杂生态系统提出一个比较统一的框架 ——
仅靠两个变量,不依赖于任何生物学细节,就可以描述任何一个生态群落。
据胡脊梁本人介绍说,这篇论文投出后,返回的审稿意见有 50 多页,但三个审稿人都给出了高度评价,“心里就有了底,感觉自己这项工作的意义得到了认可”。
MIT 官方消息,这种相图的创建,可以帮助生态学家在信息很少的情况下,对森林等自然生态系统中可能发生的情况做出预测。
MIT 直博转硕再读博
胡脊梁现在在 MIT 从事生态动力学领域研究。Science 上发表的这篇论文,是他从单细胞力学转方向后,发表的第一篇文章。
是的没错,2 年前,MIT 直博的胡脊梁,研究领域还是单细胞力学。
博士三年级那年,发生了什么?
时间回到 2017 年。那时候,胡脊梁从清华毕业,以直博生身份进入 MIT,并延续了本科阶段研究细胞动力学的路线。
郑泉水接受采访时曾回忆,博一时,胡脊梁的思维和钻研劲头让 MIT 导师们格外留意。为此,物理系专门开展了一个研讨会,讨论主题是:胡脊梁这样的学生是怎么培养出来的?
进入 MIT 后,胡脊梁于 2019 年和 2021 年先后发出两篇 PNAS(《美国科学院院报》)。
然而,“改变方向”这四个字却在他心中扎根。
胡脊梁自身惯有的学习思维偏“工程式”,更喜欢简洁有逻辑,能够从复杂现象抽象出优美模型或理论的东西。
因此,他长期认为生物学的书不太优美,存在许多冗余信息。
直到他接触了生物物理学:原来生物学也可以用简洁的语言去描述。
于是,直博第三年,胡脊梁选择“转行”,一头扎进生态动力学的河流。
这其中不仅有其自身思维方式和研究范式的原因,他现在的导师、也是 Science 所发表论文的通讯作者,Jeff Gore,提供了巨大帮助。
Jeff 是 MIT 物理学教授,研究方向正是生物物理学。
他所在的戈尔生物物理实验室,研究兴趣是利用微生物种群,探索种群或群落内部的相互作用是如何导致丰富突发现象的。
几番接触下来,胡脊梁发现 Jeff 和他思考问题的方式和兴趣方向非常契合,他深觉,如果进入 Jeff 的选题组,一定是一种“享受”。
胡脊梁主动找到 Jeff,表明自己想转到他的课题组读博的强烈意向。
在完全能够直博毕业的情况下,胡脊梁先转为硕士毕业,改投 Jeff 门下。
如愿以偿,胡脊梁进入 Jeff 的“Physics of Living System Center”课题组攻读博士学位。
“我现在在研究复杂微生物群落的动力学,这些菌群广泛存在于人体肠道、皮肤以及植物的根系和土壤。”胡脊梁介绍道,“不同种类的细菌有物种间的相互作用,物种和环境之间也有相互作用,就形成了一个完整的生态系统。”
在接受《中国科学报》采访时,胡脊梁将这次转换方向称为“可能是在 MIT 读博期间做得最正确的一个选择”。
吸引众多导师的清华钱班学生
在不同领域取得不错的成果,除了 MIT 的 5 年研究经验,还归功于本科时,胡脊梁在清华大学“钱班”夯实了基础。
何谓钱班?
2009 年,为尝试回答“钱学森之问”,清华大学成立了“清华学堂人才培养计划”钱学森力学班(以下简称钱班),每年招收本科生 30 名。
(钱学森之问的内容:为什么我们的学校总是培养不出杰出人才?)
2013 年,就读于贵阳市第一中学的胡脊梁,以理科 653 分参加钱班全国创新挑战赛,获全国第一名,并获得清华学堂计划奖学金。
在钱班,胡脊梁遇到了另一个让他获益匪浅的老师,清华钱班首席教授、中科院院士郑泉水。
本科期间,胡脊梁因产生了一个稚嫩的 idea,在寒风中与郑泉水交谈了两个多小时。
尽管这个课题最后也没有做出什么结果,但郑老师当时还是像对待一个博士生一样尊重我的想法,并培养我。
在郑泉水身上,胡脊梁学得最多的,就是一个科学家拥有的思考问题的过程。
彼时,在郑泉水的努力下,钱班先后将 SURF(Senior Undergraduate Research Fellowship,高年级学生研究员)、SRT(Student Research Training,本科生科研训练)纳入必修环节。
后来,钱班还开设 8 个学分的 ORIC(Open Research for Innovation Challenge,开放挑战性创新研究),学生需用 1 年左右的时间,独立负责一个完整的科研项目。
胡脊梁就读大一那一年,正是钱班以研究学习为目的的“进阶史研究学习系统”开始完整运行的第二年。他的 ORIC 在北京大学定量生物学中心完成。
进阶式研究学习系统给胡脊梁留下的印象,是“一个非常有效的科研培养模式”:
钱班充分尊重每名学生的兴趣和特长的同时,完成基础科研能力训练。
郑泉水老师他们不是让大家在同一个维度比高低、形成恶劣竞争。
也是大一那一年,胡脊梁就表现出了对细胞膜的好奇,满怀着憧憬,胡脊梁开始实验、观察、建理论模型。
为此,他自学 20 门研究生课程,主动联系生物系、化学系及北大生物学院的实验室。
受他的热情吸引,仅清华生命科学学院,就有 16 位教授来给钱班上课;MIT 物理系、材料系、计算机系、机械系等院系的 6 位教授也加入钱班,开设了挑战性问题课程。
因为兴趣的天平倾斜,大二时,胡脊梁进行了第一次方向转变。
那时候,胡脊梁听完西湖大学校长、中国科学院院士施一公的讲座,更觉 21 世纪是生物的时代,随即尝试往这方面发展。
据他本人描述,他大概是第一个从钱班转去做生物的。出乎他意料,郑泉水表示了大力支持。
郑泉水不仅拎出来两、三个小时专门给他讲交叉研究,还把他推荐给了清华生命科学学院教授俞立。
亟待探索生命科学世界的胡脊梁,更是主动找到力学与生物学几何方向的实验室,开启了物理生物交叉研究的篇章。
俞立对待胡脊梁这名本科生,和对待别的博士生并无二致。
和博士生同样的预算、和博士生一样使用课题组经费,不同之处在于,偶尔还有小灶 —— 补生命科学研究的课程。
“这些老师给了我很大的信心和动力。”至今,他还和郑泉水、俞立两位老师保持联系,在 MIT 的直博转硕再读博,也得到了两位老师的支持和鼓励。
总而言之,钱班在胡脊梁的学习生涯中雕刻下浓墨重彩的一笔。
回顾钱班就读生涯,胡脊梁的成绩并不算出类拔萃,但他用论文证明了自己的能力。
本科期间,胡脊梁共发表 5 篇论文,其中 1 篇还是以共同一作身份,发表在 PNAS 上。
(所以他一共发了 3 篇 PNAS)
One More Thing
胡脊梁日后的规划现在已经明了:
据中国科学报消息,在结束 MIT 的博士后研究后,他将于回国继续从事科研,做个 PI(Principle Investigator,学科研究员)。最终实现“有一天能够把生物书写得像物理书一样简洁而优美”。
他说,现在的导师 Jeff 给他的另一个启发是,以后自己做 PI 时,也要让大伙儿开开心心做科研,有自己的风格,也有一定的自由度。
“人在心情好的时候,才有创造。”
论文链接:
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm7841
参考链接:
[1]https://news.mit.edu/2022/ecosystems-instability-models-1006
[2]http://cpp.cau.edu.cn/art/2021/10/29/art_21981_793837.html
[3]https://www.tsinghua.edu.cn/info/1179/17390.htm
[4]http://www.jyb.cn/rmtzgjyb/201908/t20190816_253478.html
[5]https://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488065.shtm
本文来自微信公众号:量子位 (ID:QbitAI),作者:杨净、衡宇
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